Становлення Є. Г. Педаченка як фахівця-нейрохірурга проходило під безпосереднім впливом його батька — професора Г. П. Педаченка — одного із засновників сучасної нейрохірургії в Україні, а також професорів Інституту нейрохірургії. Суттєвий внесок в опанування методів сучасної, передусім малоінвазивної нейрохірургії, внесли видатні фахівці J. Chiu (США), P. W. Asher (Австрія), J. Hellinger (Німеччина).
Академік НАМН Є. Г. Педаченко — визнаний у світі нейрохірург, розробник напряму амбулаторної нейрохірургії (пункційних та ендоскопічних втручань). Один із засновників сучасної малоінвазивної нейрохірургії в Україні. Неодноразово проводив показові операції в країнах Європи, Північної Африки, Близького Сходу та Перської Затоки. Лектор з новітніх хірургічних технологій у галузі нейрохірургії більш ніж в 40 країнах світу.
Основні напрямки наукової діяльності:
1) Травматичні ураження головного мозку;
2) Малоінвазивні втручання в спінальній нейрохірургії, визначення напряму амбулаторної нейрохірургії;
3) Науковий аналіз та обґрунтування розвитку нейрохірургічної служби в Україні, впровадження стандартів та клінічних протоколів лікування;
4) Історія розвитку нейрохірургії в Україні.
